Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms