Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MIS18AQ9NYP9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms