Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PGPEP1Q9NXJ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PGPEP1Q9NXJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PGPEP1Q9NXJ5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PGPEP1Q9NXJ5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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