Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMT1Q9NXH9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms