Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms