Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX1Q9NSU2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms