Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT84Q9NSB2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms