Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms