Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GLB2Q9NR46 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms