Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms