Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms