Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms