Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPM3Q9HCF6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPM3Q9HCF6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms