Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPJQ9HC77 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPJQ9HC77 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms