Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms