Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00574Q9H8X3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms