Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms