Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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