Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPEF2Q9C093 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF2Q9C093 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms