Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms