Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms