Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms