Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms