Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms