Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms