Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms