Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms