Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms