Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB2BQ9BVA1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB2BQ9BVA1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms