Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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