Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms