Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms