Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms