Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms