Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAT1Q99536 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms