Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2BQ99453 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms