Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDRT15Q96T59 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms