Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms