Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms