Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms