Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms