Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPNQ96H22 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms