Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms