Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms