Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NKD2Q969F2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD2Q969F2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms