Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms