Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms