Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJA4Q8WW22 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJA4Q8WW22 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms