Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms