Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF680Q8NEM1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms